微藻通過光合作用,在地球生物圈的碳固定、初級生物量積累和能量轉化等方面發(fā)揮著重要作用。一些具有含油量高、生長速度快、抗逆性強等生理特征的微藻,具備規(guī)模生產生物柴油等可再生燃料的潛力。而目前使用的ITS等系統(tǒng)發(fā)育分子標記經常無法準確區(qū)分與鑒定種內不同藻株或屬內不同藻種。因此,開發(fā)高靈敏度和高可靠性的微藻系統(tǒng)發(fā)育分子標記具有重要意義。
近日,中國科學院青島生物能源與過程研究所功能基因組團隊博士研究生魏力、辛一等人以一類高含油的海水微藻微擬球藻(Nannochloropsis)為模式,通過對Nannochloropsis屬內的6個已知藻種共7個藻株的葉綠體和線粒體基因組進行完整測序和精細比較,首次系統(tǒng)評價了微藻細胞器基因組上所有編碼和非編碼DNA片段作為潛在系統(tǒng)發(fā)育分子標記的性能,發(fā)現(xiàn)與現(xiàn)有分子標記相比,種質區(qū)分和鑒定的靈敏度和可靠性均顯著提高的一系列新的系統(tǒng)發(fā)育分子標記。據此,提出了一種在微藻屬內進行精確種質鑒定的新策略(圖1)。該研究成果已在線發(fā)表于BMC Genomics。
上述研究由該團隊負責人徐健研究員主持,聯(lián)合美國亞利桑那州立大學胡強教授團隊和美國馬里蘭大學陳峰教授團隊共同完成,并得到了中科院創(chuàng)新團隊國際合作伙伴計劃和太陽能行動計劃的支持。