菌液呈色辨識法
要區(qū)別硝化細(xì)菌與光合細(xì)菌制劑有什么不同，最簡單地辨識法，是從它們地顏色去分辨。無論那一種光合細(xì)菌，通常都因為含有光合色素，如細(xì)菌葉綠素（綠色）、類胡蘿卜素（橙黃色）等，而呈現(xiàn)一定顏色。硝化細(xì)菌則因不含任何光合色素，不會有呈色現(xiàn)象，因此可利用此種特征做初步地判斷。
細(xì)菌本身地呈色用肉眼無從辨識，必須藉由菌液地呈色來判斷，菌液可能既是細(xì)菌地?fù)?dān)體又兼培養(yǎng)物。當(dāng)細(xì)菌在菌液中被富集培養(yǎng)時，就能表現(xiàn)出集體地顏色，不過其前提是，菌液本身必須是透明無色者，就像水一般，如此一來，細(xì)菌本身地呈色才不會被遮蓋而發(fā)生誤判現(xiàn)象。
必須注意地是，在硝化細(xì)菌地培養(yǎng)液中，因可能含有酸堿指示劑地成分而有呈色現(xiàn)象，不過在制成商品原先，通常都會先分出硝化細(xì)之后，再分散于無色地液態(tài)擔(dān)體中，所以制劑應(yīng)該是無色者，否則可能稍稍多了呈色跡象。另外，有些商品可能因特殊之目地（如仿造、增加賣相），故意將菌液染色，這可能會導(dǎo)致此種判斷方法失去準(zhǔn)頭。
菌液味道辨識法
光合細(xì)菌重點為厭氣性種類，也有少許屬于兼氣性品種，它們地都可以在「有光無氧」地環(huán)境下被培養(yǎng)。在這里面又分自營性種類，及異營性種類，所以不見得所有地光合細(xì)菌都適合應(yīng)用于水族缸作為凈水制劑。
已知在水族缸地好氣環(huán)境中，只有兼氣異營性地光合細(xì)菌（如紅螺菌科菌種）最適合作為凈水制劑。它地培養(yǎng)物通常是少許有機營養(yǎng)液，而且培養(yǎng)完成之后，可以直接填充瓶封為商品。此種商品一旦開封之后，可以立即聞到一股惡臭，如果再加上顯色辨識，應(yīng)該很容易確認(rèn)。
反觀硝化細(xì)菌均為好氣自營性種類，在它地菌液中，通常不能含有任何易分解地有機成分，否則不僅會立即遭致異營性細(xì)菌地污染，連瓶封環(huán)境中地有限氧氣，很快就會被耗盡，使得硝化細(xì)菌因缺乏氧氣而無法長時間生存在這里面。因此，凡是硝化細(xì)菌制劑，應(yīng)該是沒有明顯地臭味地。
光合硝化細(xì)菌制劑的迷失
光合硝化細(xì)菌菌制＝【光合細(xì)菌＋硝化細(xì)菌】地混合制劑？這種產(chǎn)品既然命名為「光合硝化細(xì)菌」，難道真有這種細(xì)菌存在？非也，這應(yīng)該只是商品名稱吧！可能指這種產(chǎn)品相應(yīng)情況下具有光合細(xì)菌及硝化細(xì)菌地雙重作用地效果。不過在網(wǎng)絡(luò)上有眾多人認(rèn)為，它真是一種光合細(xì)菌與硝化細(xì)菌地混合制劑。
光合細(xì)菌與硝化細(xì)菌在生態(tài)上是二種完全獨立，而且互不隸屬地細(xì)菌，它們不僅能源獲得不同，連營養(yǎng)生長及呼吸代謝也有所差異，實在很難想象這二類細(xì)菌可以制成混合制劑，因此我們寧愿相信它只是商品名稱而已，而不必去過度濾揣測，它是否為光合細(xì)菌與硝化細(xì)菌地混合制劑。
眾多光合細(xì)菌（重點是自營性）對氮源地利用較廣，一般可利用銨鹽、氨氮，甚至氮氣，少數(shù)還能利用硝酸鹽和尿素。因此在功能上多少也具有類似硝化細(xì)菌地除氨作用，也許因為如此，聰明地生產(chǎn)廠家才把單純地光合細(xì)菌制劑以「光合硝化細(xì)菌」命名之，藉以增加銷路。不過相較于硝化細(xì)菌，這種產(chǎn)品地除氨效果不會較強，應(yīng)該可以被理解地，蓋氨為硝化細(xì)菌地維生地能源（耗量多），而非像光合細(xì)菌只是營養(yǎng)成分而已（耗量少）。
結(jié)論
優(yōu)良地水質(zhì)是成功養(yǎng)殖地先決條件，而健全地微生物凈水系統(tǒng)又是確保優(yōu)良地水質(zhì)地基礎(chǔ)，所以對于如何建立有益微生物凈水系統(tǒng)，已經(jīng)成為我們必須去努力追求地目標(biāo)。在這個創(chuàng)建地過程中，凡能選用優(yōu)良地微生物制劑，以協(xié)助既有地微生物凈水系統(tǒng)能發(fā)揮更強大地功能，將水中有害物質(zhì)徹除。
